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J'arrive trop tard pour constater.

J'avais vu le même phénomène sur google il y a quelques temps. Une de mes pages était positionnée sur "mot clé 1" et sur "mot clé 2". J'ai alors viré toutes les occurences de "mot clé 1" de la page, et j'ai pu constater le phénomène suivant pendant quelques jours:
- Sur la requête "mot clé 2", ma page continuait à sortir (normal), et la page en cache était la page crawlée la veille (la page était crawlée tous les jours), c'est à dire celle qui ne contenait plus "mot clé 1".
- Beaucoup plus étonnant sur la requête "mot clé 1", ma page continuait aussi à sortir, avec cette fois une cache qui datait du dernier crawl avant disparition de "mot clé 1" de la page.

J'en avais alors conclu que google avait "de la mémoire", et se souvenait de plusieurs versions d'une même page. Il sortait visiblement la version en cache la mieux adaptée à la requête. Je crois me souvenir que la vielle cache avait définitivement disparu de gg à la mise à jour suivante de backlinks (enfin de la commande link:)

C'est peut-être ce qui s'est passé pour toi sur MSN.

Une autre explication peut être celle que tu avances (les 2 index). Mais à ma connaissance, il ne sortent pas en fonction de la requête, mais bien l'un après l'autre par alternance (de 12 heures je crois). Sauf qu'au moment du changement, il arrive pendant quelques minutes que tu puisses les voir en alternance (phénomène de round robin sur des data centers?)